RSMS menjadi salah satu peserta yang mewakili Jawa Tengah dalam TOP 99 menuju TOP 40 dengan judul “ PENETRASI ONLINE” dan “SI BINA CANTIK”. Tahap berikutnya adalah mengikuti presentasi dan wawancara di Kantor KemenPAN-RB, Jakarta tanggal 27 April 2017 yang dipresentasikan  oleh Sekda Provinsi Jawa tengah Bapak Dr. Ir. Sri Puryono Karto Soedarmo, MP yang didampingi Inovator RSMS Direktur dr. Haryadi Ibnu Junaedi, Sp.B dan Wakil Direktur Umum dan Keuangan Yunita Dyah Suminar, SKM,M.Sc,M.Si .

Inovasi yang pertama “PENETRASI ONLINE” (PENgEmbangan Sistem SMS GaTeway Menuju RegistRASI Online)  Adalah Sebuah system yang dikembangkan berdasar kebutuhan dan tuntutan masyarakat terhadap percepatan waktu tunggu pelayanan pendaftaran di RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo Purwokerto. Adapun manfaat bagi pasien antara lain Waktu Pelayanan PASTI, jadual & antrian TRANSPARAN , Reservasi 1 minggu sebelumnya. Ruang tunggu menjadi lebih aman yang berdampak komplian turun dan kepuasaan masyarakat meningkat. Keunikan dari Registrasi online adalah merubah cara konvensional dari SMS Gateway ke Online. Semua lapisan masyarakat dapat teredukasi dan  sistem ini aman serta user friendly yang dapat digunakan untuk semua penjamin.

Inovasi yang kedua “SI BINA CANTIK”  (SISTEM BRIDGING SIM RSMS, BPJS dan INA-CBG’s Menuju AkuNtabilitas, Transparansi dan EfisiensI Pelayanan Kesehatan JKN Secara Paripurna) adalah Penyederhanaan Prosedur pendaftaran 3 langkah menjadi 1 langkah yang dapat memakan waktu kurang dari 1 menit. Dengan Sistem yang sudah terintegrasi akan lebih transparan untuk iur biaya serta meminimalisir terjadi kesalahan entry data sehingga proses klaim cepat dan tepat. Dengan kedua inovasi yang sudah berjalan di RSMS diharapkan masyarakat bisa terlayani lebih baik lagi.