Pelayanan Poli Klinik Rawat Jalan Rumah Sakit Prof. Dr. Margono Soekarjo Purwokerto memberikan pelayanan prima, mencakup berbagai jenis pelayanan spesialistik  berlokasi di Jl dr Gumbreg no 1 Purwokerto. Pelayanan pada pagi hari setiap hari kerja, menyelenggarakan pelayanan untuk pasien dengan BPJS PBI dan Non PBI, Jamkesda, kerjasama maupun untuk pasien umum. Pola pelayanan ditata dengan baik dengan peralatan yang lengkap dan dilaksanakan oleh tenaga spesialis yang handal serta perawat profesional yang  terlatih di bidangnya.  Dengan sarana ruang tunggu yang efisien tepat berhadapan poli yang dikunjungi pasien sehingga memberikan kenyamanan dalam kunjungan ke poliklinik. Pendaftaran pasien poliklinik juga dilakukan dengan antrian digital di loket pendaftaran dan juga di fasilitasi dengan fasilitas antrian digital yang tersedia di masing-masing poliklinik sehingga memungkinkan pasien untuk mendapatkan pelayanan dengan baik.Adapun klinik yang tersedia adalah :