Rumah sakit memiliki fungsi utama untuk memberikan perawatan dan pengobatan yang sempurna kepada pasien baik pasien rawat inap, pasien rawat jalan, maupun pasien gawat darurat. Rekam medik elektronik di RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo Purwokerto sudah dimulai sejak tahun 2013, diawali di Instalasi Rawat Jalan (Rekam Medik Elektronik Rawat Jalan), Rawat Inap (Catatan Perkembangan Pasien Terintegrasi) dan Instalasi Bedah Sentral (order untuk tindakan operasi dari Rawat Inap / Rawat Jalan ke IBS).

Untuk menjamin kecepatan pelayanan dan keakuratan data maka RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo Purwokerto mengembangkan Rekam Medik Elektronik di IGD yang akan di implementasikan secara bertahap. Sosialisasi aplikasi Rekam Medik Elektronik IGD telah dilaksanakan pada tanggal 16 April 2016 yang dipimpin oleh Wadir Umum dan Keuangan RSUD Prof. Dr. Margono Sokerjo Purwoekrto, Yunita Dyah Suminar, SKM,M.Sc,M.Si dihadiri oleh dokter jaga IGD dan seluruh perawat primer serta perawat associate yang akan dilanjutkan training input data dokumen rekam medik IGD tanggal 20 s.d 27 April 2016 dan di implementasikan mulai tanggal 1 Mei 2016.